1、在有机相与水相混合之后测量pH
pH计是经过校准专门用来准确测定水溶液的pH值的，因为校准用的缓冲液是水溶液。如果用来测量混合了有机相的流动相，结果会有所偏差。不过重要的是测量要保持一致性。如果习惯于混合之后再测pH，也是可以的，只是在发表方法的时候要注明以便别人按同样的方法测量。

2、不使用缓冲液
缓冲液是用来保持特定的pH值并缓冲pH值的变化的。很多因素例如样品基质、空气中的CO2、甚至实验用水的来源都有可能改变流动相的pH值并造成保留时间的漂移和峰形的变化。（甲酸和TFA并不是缓冲液）
3、缓冲体系选择错误
缓冲盐的pH区间一般是±1pH。超出这个范围缓冲能力急剧下降。所以在选择缓冲体系的时候要注意体系的pH适用区间包含你所需要的pH。
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